產(chǎn)品名稱:
蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定
產(chǎn)品類別:未知類型
質(zhì)量標準:
供貨單位:
出廠價:
零售價:
信息內(nèi)容:單一蛋白質(zhì)或者蛋白混合物的蛋白質(zhì)譜鑒定/分析,以及對單一蛋白質(zhì)的蛋白序列分析是生物學研究中經(jīng)常遇到的問題?;谫|(zhì)譜法獲取蛋白質(zhì)序列的序列信息以及通過質(zhì)譜法進行蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定,蛋白質(zhì)譜分析從而實現(xiàn)蛋白質(zhì)鑒定,既protein identification,基于LC-MS的蛋白質(zhì)譜鑒定。常見分析包括:質(zhì)譜測定蛋白分子量,蛋白的N端和C端測序,蛋白質(zhì)序列分析及,翻譯后修飾位點分析等。
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百泰派克公司采用超高分辨率質(zhì)譜技術(shù),基于Thermo Fisher公司的Q Exactive質(zhì)譜儀、LTQ Orbitrap Elite質(zhì)譜儀、Orbitrap Fusion Lumos Tribrid 質(zhì)譜儀,結(jié)合 Nano-LC液相色譜技術(shù),能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)提取物、SDS-PAGE蛋白條帶、2D蛋白膠點、pull-down及co-IP等樣品中的蛋白質(zhì)進行高效精準的蛋白質(zhì)譜鑒定服務。
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百泰派克可提供以下蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定服務:
1,對純化蛋白進行蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析/質(zhì)譜鑒定;
2,對蛋白膠點,蛋白質(zhì)膠條質(zhì)譜鑒定,蛋白銀染膠質(zhì)譜鑒定,考染/熒光/Zn/Cu2+等類型染色的膠點/膠條樣品進行鑒定;可參見:蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質(zhì)鑒定服務
3,對pull-down蛋白質(zhì)譜鑒定、IP蛋白互作的IP-MS互作蛋白鑒定、co-IP質(zhì)譜驗證互作蛋白,免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜驗證,等簡單混合物樣品中的蛋白樣品進行蛋白質(zhì)鑒定/分析。
4,對復雜樣品中的未知蛋白質(zhì)進行蛋白質(zhì)譜分析/蛋白質(zhì)譜鑒定。即使是非常低濃度的蛋白樣品也可能通過蛋白質(zhì)譜鑒定
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對于單一蛋白質(zhì)和簡單蛋白混合物的鑒定,我們保證100%的鑒定率,否則不收任何費用。
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NanoLC-MS/MS分析簡單或復雜混合物中的蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析。樣品可以是來自于SDS-PAGE凝膠中的條帶或蛋白點,也可以是溶液樣品。(我司也提供1D 或2D SDS-PAGE服務,點擊了解詳情。)
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百泰派克基于質(zhì)譜的蛋白鑒定示例
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百泰派克基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定流程:
樣品前處理
首先,用二硫蘇糖醇(DTT)還原蛋白質(zhì)樣品,用碘乙酰胺(IAA)烷基化。然后用胰蛋白酶對樣品進行消化,一般樣品會在賴氨酸和精氨酸殘基后發(fā)生斷裂。最后,凍干得到多肽片段。
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上機分析
將樣品用NanoLC的A相重新溶解后上樣,在NanoLC-MS/MS系統(tǒng)下分析。
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數(shù)據(jù)庫檢索
根據(jù)樣品物種來源從UniProt下載對應物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫,使用MaxQuant、Proteome Discoverer、Peaks等軟件將液質(zhì)聯(lián)用得到的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)進行匹配,通過肽段的一級和二級碎片的質(zhì)量在數(shù)據(jù)庫中找到匹配的蛋白質(zhì),從而鑒定樣品中的蛋白質(zhì)。
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如果樣品的物種還沒有完整的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫,我們將使用親緣較近物種的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫或者是同種模式生物的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫進行蛋白鑒定分析。
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出具報告
鑒定報告中會包括詳細的樣品前處理步驟,色譜-質(zhì)譜平臺參數(shù),以及鑒定得到的蛋白質(zhì)列表和肽段列表。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)會通過網(wǎng)盤形式提供。
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您只需把您的樣品收集后提供給我們,后續(xù)所有步驟均由我們完成。百泰派克公司基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定/質(zhì)譜分析服務包括:樣品前處理-蛋白還原烷基化后使用高度特異性的蛋白酶進行蛋白樣品消化,獲得多肽片段;上機分析-通過納升級色譜(nano-flow)結(jié)合高分辨率質(zhì)譜,在最高的靈敏度下對肽段進行分離并使用超高分辨率質(zhì)譜儀采集肽段質(zhì)譜數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)庫檢索-結(jié)合樣品物種對應的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫對成千上萬張質(zhì)譜圖進行分析(使用Uniprot數(shù)據(jù)庫,每月更新一次數(shù)據(jù)庫,以確保訪問最新數(shù)據(jù)),從而實現(xiàn)樣品中蛋白的蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定;到最后出具樣品報告,均由百泰派克公司一站式完成:
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1. 客戶提供了包含一種或多種蛋白質(zhì)的樣品,如膠條,膠帶,溶液或固體樣品,pull-down或co-IP樣品。
2. 百泰派克公司根據(jù)樣品情況,選擇合適的酶,對來樣進行蛋白酶消化,然后進行nanoLC-MS / MS分析。
3. 對獲取的數(shù)據(jù)進行搜庫分析。
4. 在10-15個工作日內(nèi)收到報告。
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*如果您的樣品中含有洗滌劑/裂解劑,請在送樣單中注明。